通知指出，连云列入此次专项行动整治的港市重点主要包括以下五个方面：全市化工企业不符合主体功能区规划，通榆河清水通道沿岸两侧1公里范围内以及其他生态保护红线、化工自然保护区、企业清单水源保护区和环境敏感区域内的污染化工企业、危险化学品码头等突出问题；全市化工企业污水不达标或超标排放，整治入河排污口设置不符合相关要求，连云列入污水处理设施尚未建设、港市配套不完善、化工运行不正常，企业清单恶意偷排等突出问题；落后、污染淘汰、整治污染的连云列入化工产能或生产工艺未依法依规关闭，并向长江中上游转移，港市化工小作坊、化工黑作坊没有及时取缔等突出问题；全市化工园区外非重点监测点化工企业未进入园区（集中区），化工基础设施不配套等突出问题；全市化工企业和园区及危险化学品码头监管不到位，监管机制不健全，监管执法偏软，惩治力度偏弱等突出问题。